解剖学者、人類学者。1880（明治13）年東京医学校（現 東京大学医学部）を首席で卒業。文部省留学生に選ばれてドイツに留学。解剖学、組織学を学び、1885（明治18）年に帰国。母校で日本人最初の解剖学教授となる。ベルツに学んで、アイヌ研究などに人類学的業績を残し、日本の人類学研究、解剖学の基礎を築いた。妻の妹喜美子（1870-1956）は森鴎外の妹。