教室紹介、スタッフ紹介、研究、業績等、順天堂大学大学院 共同研究・研修室に関する様々な情報をご案内します。

順天堂大学大学院研究基盤センター
大学院医学研究科研究基盤センター共同研究・研修室(T) 附属研究施設一覧へ

リンク集


 

ソフトウェアの紹介

分子生物学的研究に有用なソフトウェアの紹介です。
<DNAシークエンシングデータの閲覧>

*Sequence Scanner 2 (Thermo Fisher Scientific社データ閲覧のみ) (for Win)

http://resource.thermofisher.com/page/WE28396_1/  (登録する必要があります)

*Four Peaks (for Mac)

https://nucleobytes.com/4peaks/index.html

<フラグメント解析データの閲覧>

*Peak Scanner 2  (Thermo Fisher Scientific社データ閲覧のみ) (for Win)

http://resource.thermofisher.com/page/WE28396_1/  (登録する必要があります)

<遺伝子の塩基配列情報>

*Ensembl

http://asia.ensembl.org/index.html

*PubMed内のNucleotide

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/

<プラスミド作画ソフト>

*SerialCloner

http://serialbasics.free.fr/Serial_Cloner.html

*ApE

http://biologylabs.utah.edu/jorgensen/wayned/ape/

<PCRプライマーの設計>

*Primer-BLAST

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

<cDNAとgenome DNAのアライメント>

*Splign

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/splign/splign.cgi

<In-Silico PCR>

*UCSC In-Silico PCR

https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr

<リアルタイムPCR解析ソフト>

*7500 software (7500 Fast Realtime PCR 専用) (for Win)

http://www.thermofisher.com/jp/ja/home/technical-resources/software-downloads/applied-biosystems-7500-fast-real-time-pcr-system.html
(インストールする際には機械のシリアル番号の入力が必要です)

*QuantStudio Design and Analysis Software (QuantStudio3/5 専用) (for Win)

https://www.thermofisher.com/jp/ja/home/technical-resources/software-downloads/ab-quantstudio-3-and-5-real-time-pcr-system.html

*ExpressionSuite Software (for Win):複数のプレートのデータを合わせて解析する際に使用、7500 softwareには同等の機能あり

https://www.thermofisher.com/jp/ja/home/technical-resources/software-downloads/expressionsuite-software.html

<細胞バンク>

*JCRB細胞バンク

http://cellbank.nibiohn.go.jp

*理化学研究所の細胞バンク

http://cell.brc.riken.jp/ja/

<論文検索>

*PubMed

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

<情報サイト>

*分子生物学研究用ツール集

http://www.yk.rim.or.jp/~aisoai/molbio-j.html

 


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